Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms