Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRIG3Q6UXM1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms