Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMBQ6PCB8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms