Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LETMD1Q6P1Q0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LETMD1Q6P1Q0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms