Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt33bQ61897 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 542.3 ms