Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND4CQ5VZ89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms