Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms