Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PERM1Q5SV97 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms