Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Mindy4Q3UQI9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Mindy4Q3UQI9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Mindy4Q3UQI9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Mindy4Q3UQI9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Mindy4Q3UQI9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Mindy4Q3UQI9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Mindy4Q3UQI9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Mindy4Q3UQI9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Mindy4Q3UQI9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mindy4Q3UQI9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mindy4Q3UQI9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms