Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC96Q2M329 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC96Q2M329 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms