Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLPPQ16740 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLPPQ16740 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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