Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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DDB1Q16531 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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DDB1Q16531 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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DDB1Q16531 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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DDB1Q16531 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDB1Q16531 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
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DDB1Q16531 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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DDB1Q16531 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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DDB1Q16531 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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DDB1Q16531 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDB1Q16531 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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