Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC85BQ15834 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC85BQ15834 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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