Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA2Q15822 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA2Q15822 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.2 ms