Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP4Q15650 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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