Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SURF1Q15526 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SURF1Q15526 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SURF1Q15526 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms