Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTCH1Q13635 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTCH1Q13635 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTCH1Q13635 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
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