Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF6Q13247 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF6Q13247 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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