Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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