Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMAN2Q12907 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMAN2Q12907 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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