Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMA1Q12791 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMA1Q12791 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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