Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A3Q01959 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms