Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRCDQ00LT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms