Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK16Q00536 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK16Q00536 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms