Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL8P80075 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL8P80075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL8P80075 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL8P80075 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL8P80075 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL8P80075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL8P80075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL8P80075 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL8P80075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL8P80075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL8P80075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL8P80075 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms