Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO4P61968 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO4P61968 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO4P61968 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO4P61968 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO4P61968 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO4P61968 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO4P61968 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO4P61968 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO4P61968 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO4P61968 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms