Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP1S1P61966 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S1P61966 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms