Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-21P61565 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-21P61565 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms