Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCDC1P59894 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms