Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTSWP56202 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTSWP56202 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTSWP56202 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTSWP56202 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTSWP56202 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTSWP56202 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTSWP56202 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTSWP56202 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTSWP56202 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTSWP56202 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTSWP56202 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTSWP56202 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTSWP56202 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTSWP56202 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTSWP56202 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms