Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D1P54289 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms