Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

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Length 841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK4P51957 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK4P51957 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK4P51957 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK4P51957 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK4P51957 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK4P51957 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK4P51957 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK4P51957 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK4P51957 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK4P51957 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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