Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SMARCA2P51531 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SMARCA2P51531 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms