Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARRES1P49788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms