Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPFP49454 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPFP49454 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPFP49454 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPFP49454 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPFP49454 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPFP49454 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPFP49454 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPFP49454 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms