Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNBP48739 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms