Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1DP48730 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms