Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCC3P46736 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms