Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A1P43005 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A1P43005 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms