Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp9P41245 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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