Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5C1P36542 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms