Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYH11P35749 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYH11P35749 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYH11P35749 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYH11P35749 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYH11P35749 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYH11P35749 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
MYH11P35749 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MYH11P35749 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms