Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC1P33527 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC1P33527 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms