Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC6A4P31645 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.1 ms