Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCND3P30281 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCND3P30281 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCND3P30281 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCND3P30281 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCND3P30281 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCND3P30281 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCND3P30281 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCND3P30281 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCND3P30281 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCND3P30281 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCND3P30281 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCND3P30281 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND3P30281 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND3P30281 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms