Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms