Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms