Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHCGRP22888 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHCGRP22888 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHCGRP22888 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms