Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms