Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COL3A1P02461 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL3A1P02461 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL3A1P02461 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms